Im Unterschied zu den Inseln Ischia und Procida hat Capri einen Karstursprung. Die Insel war einst mit der Sorrentinischen Halbinsel verbunden, dann ist sie teilweise im Meer versunken und schließlich hat sie sich vom Festland getrennt, wo sich heute die Bocca Piccola Straße befindet. Die morphologische Struktur von Capri ist sehr vielseitig, mit Gipfeln durchschnittlicher Höhe (Mt. Solaro 589 m und Mt. Tiberio 334 m) und breiten internen Hochebenen, wie zum Beispiel das Plateau von Anacapri.
Die Küste ist sehr abwechslungsreich, mit Felsen die steil zum Wasser abfallen, sowie mit Grotten, die im römischen Zeitalter als Nymphaeum herrlicher Villen dienten, die man zu dieser Zeit gebaut hat. Heutzutage ist die Blaue Grotte die berühmteste der Welt, deren bezaubernden Lichteffekte schon von zahlreichen Schriftstellern und Dichtern beschrieben worden ist. Das Wahrzeichen Capris sind die berühmten Faraglioni Felsen. Es geht um drei kleine Steininselchen, die nicht weit vor der Küste in voller Pracht stehen, indem ein spektakulärer Landschaftseffekt in entsteht.
Auf Capri sind keine Trinkwasserquellen vorhanden. Dafür ist die Insel aber sehr reich an Tier- und Pflanzenarten, wobei manche davon sehr selten sind, wie zum Beispiel die blaue Eidechse, die auf den Faraglioni Felsen lebt. Die Vegetation Capris ist typisch für den Mittelmeerraum, wobei auf eine überwiegende Mehrheit von Agaven, Feigenkakteen und Stechginster hinzuweisen ist.